根据国家质检总局《关于进行集中审单管理系统试点的通知》（质检通函[2009]408号）及《关于推广应用集中审单管理系统的通知》（沪检综函[2010]443号）要求，自2010年起，上海检验检疫局各分支局、办事处积极稳妥地推广应用了集中审单管理模式。至2011年底，除机场局检务处、货检处和龙吴办事处外，上海局90%的检务工作点已使用了集中审单系统。
012年4月13日，上海机场局检务处、货检处和上海局龙吴办事处集中审单系统正式上线。截止目前，上海检验检疫局集中审单日均受理达1.5万批，专业审单80余批，现场检务受理1.1万批，其中上海机场局检务处、货检处日均受理2300余批，上海局龙吴办日均受理100余批。机场局检务处、货检处和龙吴办的成功上线标志着集中审单系统在上海局所有的检务工作点达到了全覆盖，实现了真正意义上集中审单机构覆盖率100%的目标，标志着上海局检务工作全面进入集中审单时代。
集中审单系统的全面应用，彻底改变了传统记录式的检务人工审单模式，通过在系统中设定的审单规则，把标准的审单要求转化为审单指令下达到具体工作上，通过电子审单、专业审单和现场审单的有机结合，将检务审单向纵深延伸，实现了精细化审单的目标；电子审单的运用，还实现了365天24小时实时审单和智能化审单，大大提高了审单效率，加快了通关速度；标准化的审单口径有效规范了检务工作，为上海地区实现通报通放和报检签证一体化打下了良好的基础。
